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BaseScope™  超高感度 RNA in situ ハイブリダイゼーション試薬



>> RNAscope® 製品概要はこちらから
  • RNAscope® で実績のあるACD社の New Technology!!
  • RNAscope® テクノロジーをベースとした超高感度 RNA in situ hybridization (RNA-ISH) システムを採用!
  • Splicing variant、exon-exon junction、short target*1、point mutation の解析にて威力を発揮する染色解析システムです
  •  *1: 50-300 nt 程度が対象です(成熟 miRNA は対象外になります)

    basescope


WORKFLOW

 

BaseScope流れ 前処理→ハイブリダイズ→シグナル増幅→検鏡

① 脱パラフィン等、BaseScope™ に最適化された前処理
② ターゲットRNAに、特異的かつ相補的に設計した Z 型オリゴプローブペアをハイブリダイズ
③ 独自の Branched DNA Technology を活用した BaseScope™ 増感ステップ
  *注意点: 増感システムが異なるため、RNAscope® と BaseScope™ の間に互換性はありません
④ 増幅されたターゲットRNAのシグナルを検鏡(名視野もしくは赤色蛍光)


ワークフロー詳細
RNAscope® と同様の工程を経て、約8時間ほど要します(約30分ほどRNAscope® 1-Plex Redより長いです)。


BaseScope™ と RNAscope® の違い

basescope_platform


RNAscope® BaseScope™
ZZ プローブの数 平均20 ZZプローブ(最小6 ZZプローブ) 1−6 ZZ プローブ
シグナル増幅方法 2.5 version 新しいシグナル増幅方法
ターゲット遺伝子 • mRNA >300 bases
• lncRNA > 300 bases
RNA 50−300 bases
エキソンジャンクション・ショートターゲット
アプリケーション mRNA または LncRNA Splice variant, circular RNA, highly
homologous sequence, CDR sequence
for T cell clone (TCR), snoRNA, pre-miRNA
同時検出可能な遺伝子数 最大3重染色まで可能 単染色のみ
検出 発色または蛍光 発色 Fast RED のみ
自動染色 マニュアルまたはオートメーション マニュアルのみ
サンプルタイプ • FFPE 切片 (TMAs)
• 固定凍結組織・新鮮凍結組織
• 培養細胞・PBMC
• FFPE 切片 (TMAs)
• 新鮮凍結組織
• 培養細胞
前処理キット             RNAscope® pretreatment(共通試薬)
検出キット RNAscope® kit BaseScope™ kit
プローブ RNAscope® probe BaseScope™ probe

*注意点: 増感システムが異なるため、RNAscope® と BaseScope™ の間に互換性はありません。



Applications

BaseScopeシステムが適したアプリケーション
クリックで拡大できます。


*ご注意: Point mutation 解析につきましてはお問い合わせください。
 >>お問い合わせフォーム


代表的な必要試薬・機器など(詳細一覧)

 

BaseScopeの実施に必要な試薬・機器
*最新情報はACD社のHPにて公開(リンクはこちら https://acdbio.com/)


染色例:スプライスバリアント検出(Exon-Junction analysis)

 

■BaseScope™ アッセイを用いた METΔ14 RNA の検出

BaseScope染色例



検出キット/キット構成品

Category Code No. Product Name Visualization Type of Assay Color Price
キャン
ペーン価格
Unit
検出キット 322900 BaseScope™ Reagent Kit- RED 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥225,000
¥157,500
1 KIT
[20 slides]
キット構成品
(AMP類の
セット)
322910 BaseScope™ Detection Reagents- RED 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥175,000
¥122,500
1 KIT
[20 slides]

イントロパック

Category Code No. Product Name Visualization Type of Assay Color Price
キャン
ペーン価格
Unit Species
イントロパック 322970 BaseScope™ Intro Pack- Reagent Kit- Red-Hs 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥325,000
¥227,500
1 PACK
[20 slides]
Human
322971 BaseScope™ Intro. Pack- Reagent Kit- Red-Mm 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥325,000
¥227,500
1 PACK
[20 slides]
Mouse

コントロールパック/プローブ

Category Usage Code No. Product Name Type of Assay Price
キャン
ペーン価格
Unit Species
BaseScopeコントロールパック コントロールパック 322975 BaseScope™ Control Probe Pack-Hu BaseScope™ (1-plex) ¥90,000
¥63,000
1 PACK
[for 20 slides]
Human
322976 BaseScope™ Control Probe Pack-Mm BaseScope™ (1-plex) ¥90,000
¥63,000
1 PACK
[for 20 slides]
Mouse
ネガティブコントロール 701011 BaseScope™ Negative Control Probe DapB-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
-
701021 BaseScope™ Negative Control Probe DapB-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
-
ポジティブコントロール 701031 BaseScope™ Positive Control Probe Hs-PPIB-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
Human
701041 BaseScope™ Positive Control Probe Hs-PPIB-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
Human
701071 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Ppib-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
701081 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Ppib-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
701091 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Polr2a-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
701101 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Polr2a-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000
¥16,100
1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
ターゲットプローブ (カタログ掲載) catalog target ○○○○○○ (Inventory No.) ACD社のカタログ掲載名
(ACD社のHPにて最新情報が検索可能です)
→ ACD社のHPリンクはこちら(https://acdbio.com/
BaseScope™ (1-plex) お問い合わせ 1 VIAL
[for 20 slides]
any
新規BaseScope™ プローブ
(カタログ未掲載/カスタム)
original target お問い合わせ 価格やご注文方法など、
お気軽にお問い合わせ
ください
BaseScope™ (1-plex) お問い合わせ 1 VIAL
[for 20 slides]
any

前処理試薬/洗浄試薬

Category Code No. Product Name Price
キャン
ペーン価格
Unit Component
キット構成品
(ユニバーサル
キット)
322380 Universal Pretreatment Reagents ¥63,000
¥44,100
12 bottles ・Hydrogen peroxide (2 bottles)
・Target retrieval (4 bottles)
・Protease Plus (2 bottles)
・Protease III (2 bottles)
・Protease IV (2 bottles)
キット構成品
(前処理試薬)
322381 RNAscope® H2O2 and Protease Reagents ¥25,000
¥17,500
8 bottles ・Hydrogen peroxide (2 bottles)
・Protease Plus (2 bottles)
・Protease III (2 bottles)
・Protease IV (2 bottles)
322330 RNAscope® H2O2 and Protease Plus Reagents ¥30,000
¥21,000
3 bottles ・Hydrogen peroxide (2 bottles)
・Protease Plus Reagent
 (1 bottle)
322340 RNAscope® Protease III and Protease IV Reagents ¥25,000
¥17,500
3 bottles ・Protease III (1 vial)
・Protease IV (2 vials)
322000 RNAscope® Target Retrieval Reagents ¥19,000
¥13,300
4 bottles
(70ml each)
・Target Retrieval reagent
 (4 bottles)
キット構成品
(洗浄試薬)
310091 RNAscope® Wash Buffer Reagents ¥25,000
¥17,500
4 bottles
(60ml each)
・4 bottles of 50X Wash Buffer
 (60ml each)

オーブン/パップペン(機器類)

Category Code No. Product Name Price
キャンペーン価格
ハイブリオーブンシステム 321710 ACD HybEZ™ II Hybridization System (110v) With ACD EZ-Batch™ Slide System ¥563,000
¥394,100
パップペン 310018 ImmEdge™ Hydrophobic Barrier Pen ¥8,000
¥5,600

*旧型のハイブリオーブンに関連する商品の取扱いは終了となりました。
<該当商品>
・Code No. 310010 (ACD HybEZ™ Hybridization System (110v)
・Code No. 321461 (ACD HybEZ™ Hybridization System (110V AC) With ACD EZ-Batch™ Slide System)