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BaseScope™  超高感度 RNA in situ ハイブリダイゼーション試薬



WORKFLOW

 

BaseScope流れ 前処理→ハイブリダイズ→シグナル増幅→検鏡

① 脱パラフィン等、BaseScope™ に最適化された前処理
② ターゲットRNAに、特異的かつ相補的に設計した Z 型オリゴプローブペアをハイブリダイズ
③ 独自の Branched DNA Technology を活用した BaseScope™ 増感ステップ
  *注意点: 増感システムが異なるため、RNAscope® と BaseScope™ の間に互換性はありません
④ 増幅されたターゲットRNAのシグナルを検鏡(名視野もしくは赤色蛍光)


   RNAscope® と同様の工程を経て、約8時間ほど要します(約60分ほどRNAscope® 1-Plex Redより長いです)。


BaseScope™ と RNAscope® の違い

basescope_platform

RNAscope® BaseScope™
ZZ プローブの数 平均20 ZZプローブ(最小6 ZZプローブ) 1−6 ZZ プローブ
シグナル増幅方法 2.5 version 新しいシグナル増幅方法
ターゲット遺伝子 • mRNA > 300 bases
• lncRNA > 300 bases
RNA 50−300 bases
エキソンジャンクション・ショートターゲット
アプリケーション mRNA または LncRNA Splice variant, circular RNA, highly
homologous sequence, CDR sequence
for T cell clone (TCR), snoRNA, pre-miRNA
同時検出可能な遺伝子数 最大4重染色まで可能 単染色のみ
検出 発色または蛍光 発色 Fast RED のみ
自動染色 マニュアルまたはオートメーション マニュアルのみ
サンプルタイプ • FFPE 切片 (TMAs)
• 固定凍結組織・新鮮凍結組織
• 培養細胞・PBMC
• FFPE 切片 (TMAs)
• 新鮮凍結組織
• 培養細胞
前処理キット             RNAscope® pretreatment(共通試薬)
検出キット RNAscope® kit BaseScope™ kit
プローブ RNAscope® probe BaseScope™ probe

*注意点: 増感システムが異なるため、RNAscope® と BaseScope™ の間に互換性はありません。



Applications

BaseScopeシステムが適したアプリケーション
クリックで拡大できます。


*ご注意: Point mutation 解析につきましてはお問い合わせください。
 >>お問い合わせフォーム

染色例:スプライスバリアント検出(Exon-Junction analysis)

 

■ BaseScope™ アッセイを用いた METΔ14 RNA の検出

BaseScope染色例


代表的な必要試薬・機器など(詳細一覧

 

BaseScopeの実施に必要な試薬・機器
*最新情報はACD社のHPにて公開(リンクはこちら https://acdbio.com/)

マニュアルダウンロード

 

BaseScope™をお使いいただくには、「キット」「プローブ」「コントロール」「機器、その他」を選んでいただく必要があります。
検出標的の数、可視化方法およびサンプルの種類に応じて、下記より必要なキットを選択ください。
ユーザーマニュアルは、「前処理」と「検出」工程に分けて準備されていますので、用途に応じて入手ください。

ユーザーマニュアル(検出) ユーザーマニュアル(前処理)
323900-USM PDF FFPE Fixed Frozen Fresh Frozen
323900-USM PDF TN 320534 PDF MK 50-013 PDF


価格表

 

BaseScope™キットがバージョンアップしました!
従来品と比較し、よりバックグラウンドが抑えられ、より綺麗に検出できるようになりました。
プローブの設計には変更ありませんので、すでに購入済みのBaseScope™プローブもご使用いただけます。
RNAscope®と共通に使用できる前処理キット(賦活化バッファーやプロテアーゼ)にも変更はありません。

検出キット/キット構成品

Category Code No. Product Name Visualization Type of Assay Color Price Unit
検出キット 323900 BaseScope™ Reagent Kit v2- RED 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥225,000 1 KIT
[20 slides]
キット構成品
(AMP類の
セット)
323910 BaseScope™ Detection Reagents v2- RED 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥175,000 1 KIT
[20 slides]

イントロパック

Category Code No. Product Name Visualization Type of Assay Color Price Unit Species
イントロパック 322970 BaseScope™ Intro Pack- Reagent Kit v2- Red-Hs 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥325,000 1 PACK
[20 slides]
Human
323971 BaseScope™ Intro Pack- Reagent Kit v2- Red-Mm 色素(蛍光) BaseScope™ (1-plex) Red ¥325,000 1 PACK
[20 slides]
Mouse

プローブ

カタログ・プローブ
Code No. Product Name Usage Species Price
○○○○ BaseScope Probe-○○○○ ターゲットプローブ any ¥150,000

カスタム・プローブ
既存ブローブが無い場合、プローブのカスタム作製も承ります。


プローブ合成費 ¥150,000 + プローブ設計費 ¥150,000 = ¥300,000

※カスタムで作製したプローブを再購入する場合はプローブ設計費は不要です。
ターゲット配列を非公開でプローブ作製をご希望の場合には、ACD社との秘密保持契約締結の上作製が可能です。お見積もりなど、詳しくはお問い合わせください。


コントロール・プローブ
Category Usage Code No. Product Name Type of Assay Price Unit Species
BaseScope
コントロール
コントロールパック 322975 BaseScope™ Control Probe Pack-Hu BaseScope™ (1-plex) ¥90,000 1 PACK
[for 20 slides]
Human
322976 BaseScope™ Control Probe Pack-Mm BaseScope™ (1-plex) ¥90,000 1 PACK
[for 20 slides]
Mouse
ネガティブコントロール 701011 BaseScope™ Negative Control Probe DapB-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
-
701021 BaseScope™ Negative Control Probe DapB-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
-
ポジティブコントロール 701031 BaseScope™ Positive Control Probe Hs-PPIB-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
Human
701041 BaseScope™ Positive Control Probe Hs-PPIB-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
Human
701071 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Ppib-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
701081 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Ppib-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
701091 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Polr2a-3ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse
701101 BaseScope™ Positive Control Probe Mm-Polr2a-1ZZ BaseScope™ (1-plex) ¥23,000 1 VIAL
[for 20 slides]
Mouse

前処理試薬/洗浄試薬

Category Code No. Product Name Price Unit Component
キット構成品
(ユニバーサル
キット)
322380 Universal Pretreatment Reagents ¥63,000 12 bottles ・Hydrogen peroxide (2 bottles)
・Target retrieval (4 bottles)
・Protease Plus (2 bottles)
・Protease III (2 bottles)
・Protease IV (2 bottles)
キット構成品
(前処理試薬)
322381 RNAscope® H2O2 and Protease Reagents ¥25,000 8 bottles ・Hydrogen peroxide (2 bottles)
・Protease Plus (2 bottles)
・Protease III (2 bottles)
・Protease IV (2 bottles)
322330 RNAscope® H2O2 and Protease Plus Reagents ¥30,000 3 bottles ・Hydrogen peroxide (2 bottles)
・Protease Plus Reagent
 (1 bottle)
322340 RNAscope® Protease III and Protease IV Reagents ¥25,000 3 bottles ・Protease III (1 vial)
・Protease IV (2 vials)
322000 RNAscope® Target Retrieval Reagents ¥19,000 4 bottles
(70ml each)
・Target Retrieval reagent
 (4 bottles)
キット構成品
(洗浄試薬)
310091 RNAscope® Wash Buffer Reagents ¥25,000 4 bottles
(60ml each)
・4 bottles of 50X Wash Buffer
 (60ml each)

オーブン/疎水バリアペン(機器類)

Category Code No. Product Name Price
ハイブリオーブンシステム 321710 ACD HybEZ™ II Hybridization System (110v) With ACD EZ-Batch™ Slide System ¥563,000
疎水バリアペン 310018 ImmEdge™ Hydrophobic Barrier Pen ¥8,000

*旧型のハイブリオーブンに関連する商品の取扱いは終了となりました。
<該当商品>
・Code No. 310010 (ACD HybEZ™ Hybridization System (110v)
・Code No. 321461 (ACD HybEZ™ Hybridization System (110V AC) With ACD EZ-Batch™ Slide System)