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新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)研究用ツール



2020/9/16更新!

エピトープペプチドのスクリーニングや、ワクチンの効果の評価研究に

今、世界中で新型コロナウイルス感染症(COVID-19)に対するワクチン開発が急ピッチで進められています。すでにSARS-CoV-2のタンパク質配列は解明されており、免疫応答に関与するエピトープの候補が複数報告されています。

文献タイトル
A Sequence Homology and Bioinformatic Approach Can Predict Candidate Targets for Immune Responses to SARS-CoV-2
⇒ エピトープ候補が製品になりました!MHCとのアフィニティも確認済です。リストはこちら!
Candidate targets for immune responses to 2019-Novel Coronavirus (nCoV): sequence homology- and bioinformatic-based predictions

T細胞を介した免疫誘導に効果的なペプチドのスクリーニングや、ワクチンの効果の評価研究には、MHCテトラマー試薬が活躍します。

  • 免疫原性が高いワクチン候補ペプチドはどれ?
  • ワクチン候補ペプチドのMHC class Iアリルおよびclass IIアリルに対する結合親和性は?
  • ワクチンによるT細胞を介した免疫は誘導されている?持続している?

製品・サービス

独自のペプチド交換反応技術により、任意のペプチドを用いて簡単にMHCテトラマー試薬を作ることのできるキットです。本キットを用いることにより、SARS-CoV-2抗原の予測配列とH-2Kb, HLA-A2, A24, A11アリルとの結合親和性を比較することが可能です。
※class IIアリル対応のキットは、発売準備中です。


ご希望のペプチドで MHC class I, class II テトラマー試薬を作製します。SARS-CoV-2抗原に特異的なT細胞を検出するための試薬を作製することが可能です。


SARS-CoV-2 MHCテトラマー★更新あり

HLA-A*02:01拘束性の、4種類のSARS-CoV-2 Spike Glycoproteinのエピトープを結合させたMHCテトラマーを発売しました。
ヒトサンプルにおいて抗原特異的T細胞の存在が確認されています(参考文献)。

アリルペプチド配列PEAPCBV421Biotinylated
monomer
HLA-A*02:01RLNEVAKNL TB-0174-1 TB-0174-2 TB-0174-4 TB-0174-M
HLA-A*02:01KLPDDFTGCV TB-0175-1 TB-0175-2 TB-0175-4 TB-0175-M
HLA-A*02:01YLQPRTFLL TB-0176-1 TB-0176-2 TB-0176-4 TB-0176-M
HLA-A*02:01RLQSLQTYV TB-0177-1 TB-0177-2 TB-0177-4 TB-0177-M

SARS-CoV-2 エピトープペプチド★更新あり

QuickSwitch™ カスタム テトラマーキットを用いて、SARS-CoV-2のエピトープペプチド候補とアリルのアフィニティを確認しています。現在、MHC class I, IIに対応するペプチド52種類をラインナップしています。
※下表の品番をクリックすることで、製品の詳細をご覧いただけます。

◇ MHC class II
Code No.ペプチド配列ターゲット領域アフィニティの有無
DRB1*01:01DRB1*04:01DRB1*15:01
SPC001EAFEKMVSLLSVLLSSARS-CoV-2 ORF1ab polyprotein (3906-3920)+++
SPC002EEIAIILASFSASTSSARS-CoV-2 ORF1ab polyprotein (471-485)+++
SPC003ESPFVMMSAPPAQYESARS-CoV-2 ORF1ab polyprotein (1801-1815)+++
SPC004FYVYSRVKNLNSSRVSARS-CoV-2 envelope protein (56-70)+++
SPC005LEASFNYLKSPNFSKSARS-CoV-2 ORF1ab polyprotein (2211-2225)+++
SPC006LLLLDRLNQLESKMSSARS-CoV-2 nucleocapsid phosphoprotein (221-235) ++
SPC007LSYYKLGASQRVAGDSARS-CoV-2 membrane glycoprotein (176-190)+++
SPC008MDLFMRIFTIGTVTLSARS-CoV-2 ORF3a protein (1-15)+++
SPC009MWLSYFIASFRLFARSARS-CoV-2 membrane glycoprotein (91-105)+++
SPC010RAMPNMLRIMASLVLSARS-CoV-2 ORF1ab polyprotein (5016-5030)+++
SPC011SEFSSLPSYAAFATASARS-CoV-2 ORF1ab polyprotein (3946-3960)+++
SPC012TRFQTLLALHRSYLTSARS-CoV-2 chain A spike glycoprotein (236-250) +++
SPC013WPQIAQFAPSASAFFSARS-CoV-2 nucleocapsid phosphoprotein (301-315) +++
SPC014YFTSDYYQLYSTQLSSARS-CoV-2 ORF3a protein (206-220)++
SPC046ADYSVLYNSASFSTFSARS-CoV-2 chain A spike glycoprotein (363-377) +++
SPC047IWLGFIAGLIAIVMVSARS-CoV-2 surface glycoprotein (1216-1230) ++
SPC048LAFVVFLLVTLAILTSARS-CoV-2 envelope protein (21-35) +
SPC049MKIILFLALITLATCSARS-CoV-2 ORF7a protein (1-15) ++
SPC050NRNRFLYIIKLIFLWSARS-CoV-2 membrane glycoprotein (41-55) +++
SPC051RVVVLSFELLHAPATSARS-CoV-2 chain A spike glycoprotein (509-523) +++
SPC052TQDLFLPFFSNVTWFSARS-CoV-2 chain A spike glycoprotein (51-65) +++
Code No.ペプチド配列ターゲット領域DRB1*01:01DRB1*04:01DRB1*15:01
アフィニティの有無

■QuickSwitch™ Tetramer kitを用いたペプチド交換効率測定データ
※class IIアリル対応のキットは、発売準備中です。


クリックで拡大できます。

◇ MHC class I
Code No.ペプチド配列ターゲット領域アフィニティの有無
A*02:01A*03:01A*11:01A*24:02
SPC015FLAHIQWMVSARS-CoV-2 ORF1ab (3122-3130) +
SPC016FLLNKEMYLSARS-CoV-2 ORF1ab (3183-3191) +
SPC017LLLDDFVEIISARS-CoV-2 ORF1ab (6749-6758) +
SPC018LLYDANYFLSARS-CoV-2 ORF3a protein (139-147) ++
SPC019SMWALIISVSARS-CoV-2 ORF1ab (3732-3740) +
SPC020TLMNVLTLVSARS-CoV-2 ORF1ab (3710-3718) +
SPC021YLDAYNMMISARS-CoV-2 ORF1ab (6419-6427) +
SPC022YLNTLTLAVSARS-CoV-2 ORF1ab (6851-6859) +
SPC023YLYALVYFLSARS-CoV-2 ORF3a protein (107-115) +
SPC024ASMPTTIAKSARS-CoV-2 ORF1ab (2192-2200) ++
SPC025KSAGFPFNKSARS-CoV-2 ORF1ab (4892-4900) ++
SPC026KTFPPTEPKSARS-CoV-2 nucleocapsid phosphoprotein (362-370) ++
SPC027STFNVPMEKSARS-CoV-2 ORF1ab (2600-2608) ++
SPC028TTIKPVTYKSARS-CoV-2 ORF1ab (1875-1883) ++
SPC029DYVYNPFMISARS-CoV-2 ORF1ab (6159-6167) +
SPC030FYGGWHNMLSARS-CoV-2 ORF1ab (4986-4994) +
SPC031NYLKRRVVFSARS-CoV-2 ORF1ab (3159-3167) +

Code No.ペプチド配列ターゲット領域アフィニティの有無
H-2KbHLA-A*02:01
SPC032VNFNFNGLChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (539-546)+
SPC033MAYRFNGIChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (902-909)+
SPC034INITRFQTLChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (233-241)+
SPC035VVLSFELLChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (511-518)+
SPC036SIVRFPNIChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (325-332)+
SPC037GNYNYLYRLChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (447-455)+
SPC038VVFLHVTYVChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (1060-1068)++
SPC039SIIAYTMSLChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (691-699)++
SPC040KLPDDFTGCVChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (424-433)+
SPC041VTQLYLGGMORF1ab polyprotein SARS-CoV-2 (5385-5393)+
SPC042ISDEFSSNVORF1ab polyprotein SARS-CoV-2 (5583-5591)+
SPC043ITGLYPTLORF1ab polyprotein SARS-CoV-2 (5573-5580) Peptide+
SPC044AAYYVGYLChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (263-270) Peptide+
SPC045YNYLYRLFChain A, SARS-CoV-2 spike glycoprotein (449-456) Peptide+

参考文献
  • ・Poluektov Y et al., Assessment of SARS-CoV-2 Specific CD4(+) and CD8 (+) T Cell Responses Using MHC Class I and II Tetramers. bioRxiv. doi: 10.1101/2020.07.08.194209 (2020)
  • ・Herrmann A et al., A Targeted Vaccine against COVID-19: S1-Fc Vaccine Targeting the Antigen-Presenting Cell Compartment Elicits Protection against SARS-CoV-2 Infection. bioRxiv. doi: 10.1101/2020.06.29.178616 (2020)
  • ・Zhang Y et al., The ORF8 Protein of SARS-CoV-2 Mediates Immune Evasion through Potently Downregulating MHC-I. bioRxiv. doi: 10.1101/2020.05.24.111823 (2020)
  • ・Alina S. Shomuradova AS, et al., SARS-CoV-2 epitopes are recognized by a public and diverse repertoire of human T-cell receptors. bioRxiv. doi: 10.1101/2020.05.20.20107813 version 2 (2020)
  • ・Chour W et al., Shared Antigen-specific CD8+ T cell Responses Against the SARS-COV-2 Spike Protein in HLA A*02:01 COVID-19 Participants. bioRxiv. doi: 10.1101/2020.05.04.20085779 (2020)
  • ・Wang B et al., Identification of an HLA-A*0201–restricted CD8+ T-cell epitope SSp-1 of SARS-CoV spike protein. Blood. 104, 200–206 (2004) PMID: 15016646