DNAオリゴ・RNAオリゴ合成受託

Genes:人工遺伝子合成受託サービス

人工遺伝子合成サービスでは、お客様から頂いたDNA配列の情報から、2本鎖DNAを合成します。
「Genes」というサービスでは、2本鎖DNAをベクターに挿入したプラスミドを納品致します。
プラスミドに入っていない2本鎖DNAを納品する「gBlocks® Gene Flagment」というサービスもございます。
>> gBlocks®についての詳細は、こちらのページをご覧下さい。

例えば下記の用途にご使用ください。

  cDNAクローニング
  バリアント作製(ミューテーション、抗体など)
  人工配列(リンカー、ベクター構築など)

サービス一覧

サービス名 対応配列長 価格(税別) 納期
Genes
(※プラスミドで納品)
miniGene 25~500 bp 一律 22,000円 約2週間
Gene 501 bp ~ 55円/bp 別表参照
gBlocks® Gene Fragment
(※2本鎖DNA状態で納品)
gBlocks® 125-500 125 ~ 500 bp 14,000円 1~2週間
gBlocks® 501-750 501 ~ 750 bp 20,000円
gBlocks® 751-1000 751 ~ 1,000 bp 24,000円 2~3週間
gBlocks® 1001-1250 1,001 ~ 1,250 bp 32,000円
gBlocks® 1251-1500 1,251 〜 1,500 bp 39,000円
gBlocks® 1501-1750 1,501 〜 1,750 bp 46,000円
gBlocks® 1751-2000 1,751 〜 2,000 bp 54,000円
gBlocks® Libraries 251 ~500 bp 詳細はこちら
※頂いた配列による合成困難性がある場合や、非常に長い配列の場合、55円/bpでは提供出来ない場合があります。
※事前の確認にも関わらず合成できない事が稀にございます。その場合は、弊社都合キャンセルとし、費用は頂きません。

Genes

ご依頼頂きました配列を、ベクターに挿入したプラスミドの形で納品致します。
合成した配列をシーケンスし、正確に合成出来ているかどうかも確認しております。
確認の際に用いたシーケンスデータとプラスミドマップはIDTウェブサイトよりダウンロード可能です。

また、タンパク質の発現量を増やすため、もしくは、配列による合成困難性を解消するため、 コード配列のアミノ酸情報を保ったまま、配列を変換する事(コドン変換)も無償で承っております。
Genes 価格
塩基長 価格(税別)
~500bp (miniGene) 22,000円
501bp ~ 55円/bp
※頂いた合成困難性がある場合や、非常に長い配列の場合、55円/bpでは提供出来ない場合があります。
※事前の確認にも関わらず合成できない事が稀にございます。その場合は、弊社都合キャンセルとし、費用は頂きません。
Genes 納期
塩基長 予定納期
~500bp (miniGene) 約2週間
501bp ~ 約1,000bp 2~3週間
約1,000bp ~ 約1,500bp 3~4週間
約1,500bp ~ 約2,000bp 4~5週間
約2,000bp ~ 約2,500bp 5~6週間
約2,500bp ~ 約4,000bp 6~8週間
約4,000bp ~ 2,000,000bp 未定・配列次第
※配列によって納期が変動する場合があります。 また、合成困難性がある場合は、納期はさらに1~2週間長くなります。
Genes ベクター
ベクターの選択について
下記の7種類のベクターを用意しております。カテゴリを選択いただくと、カテゴリ内のベクターが選択されるシステムです。
特定のベクターを指定することは出来ませんので、ベクターを一種に限定したい場合は、アンピシリン耐性ベクター (pBlueScript系)をご指定ください。
ただし pBlueScript系を選択した場合には別途費用が発生いたします。

カテゴリーとベクター一覧
アンピシリン耐性
(pUC系)
アンピシリン耐性
(pBlueScript系)
カナマイシン耐性
(pUC系)
クロラムフェニコール耐性
pIDTSMART-AMP
pUCIDT-AMP
pIDTBluepIDTSMART-KAN
pUCIDT-KAN
BAC 2
BAC 3
・配列長によって選択できるベクターは異なります。 下記の表をご参照ください。

pBlueScript系ベクター選択時の追加費用
blunt挿入方向指定なし¥7,500
5' to T7 promoter 5' から 3' 方向に配列を挿入します。 ¥11,250
5' to T3 promoter 3' から 5' 方向に配列を挿入します。 ¥11,250
・5' to T7 promoter: T7プロモーター側に、ご依頼いただいた配列の5'末端が挿入されます。

配列長と選択できる耐性遺伝子
配列長アンピシリン耐性
(pUC系)
アンピシリン耐性
(pBlueScript系)
カナマイシン耐性
(pUC系)
クロラム
フェニコール耐性
25 ~ 1,500 bp×
1,501 ~ 5,000 bp××
5,001 bp ~×××
ベクター詳細
弊社から提供できるベクターにマルチクローニングサイトはございませんので、発注の際に必要な制限酵素サイトを遺伝子の末端に付加して下さ い。
下記に各ベクターの詳細を記載致します。
pIDTSMART
pIDTSMART-Amp ベクターマップ
pIDTSMART-Amp ベクターマップ
※カナマイシン耐性ベクターはAmpicillin部位がkanamaycinとなりま す。

pIDTSMART-Ampの配列情報
2,056bp
pIDTSMART-kanの配列情報
1,926bp
※ご依頼のDNA配列と上記のプラスミド配列との間には、ランダムな配列が挿入されます。

M13 sequence
M13 Fw(-20):5'- GTA AAA CGA CGG CCA GT -3'
M13 Rv(-27):5'- CAG GAA ACA GCT ATG AC -3'
※配列確認データ上では、M13Rv(-27)は相補鎖の[5'- GTCATAGCTGTTTCCTG -3']と記載されます。
pUCIDT
pUCIDT-Amp ベクターマップ
pUCIDT-Amp ベクターマップ
※カナマイシン耐性ベクターはAmpicillin部位がkanamaycinとなりま す。

pUCIDT-Ampの配列情報
2,752bp
pUCIDT-Kanの配列情報
3409 bp
※ご依頼のDNA配列と上記のプラスミドとの間には、ランダムな配列が挿入されます。



M13 sequence
M13 Fw(-41):5'- CGC CAGGGTTTTCCCAGTCACGAC -3'
M13 Fw(-20):5'- GTA AAACGACGGCCAGT-3'
M13 Rv(-27):5'- CAG GAAACAGCTATGAC-3'
M13 Rv(-48):5'- AGC GGATAACAATTTCACACAGG -3'
※配列確認データ上では、M13Rv(-27)は相補鎖[5'- GTCATAGCTGTTTCCTG -3']と、 M13Rv(-48)は相補鎖[5'- CCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT -3']と記載されます。
pIDTBlue
pIDTBlueのベクターマップ
pIDTBlueのベクターマップ

pIDT-Blueの配列情報
2951 bp
※ご依頼のDNA配列と上記のプラスミドとの間には、ランダムな配列が挿入されます。 M13 sequence
M13 Fw(-41):5'- CGC CAGGGTTTTCCCAGTCACGAC -3'
M13 Fw(-20):5'- GTA AAACGACGGCCAGT-3'
T7 Promoter:5'- TAATACGACTCACTATAGGG -3'
T3 Promoter:5'- GGGAAATCACTCCCAATTAA -3'
M13 Rv(-27):5'- CAG GAAACAGCTATGAC-3'
M13 Rv(-48):5'- AGC GGATAACAATTTCACACAGG -3'

※配列確認データ上では、T3 Promoterは相補鎖[5'- CCCTTTAGTGAGGGTTAATT -3']、M13Rv(-27)は相補鎖[5'- GTCATAGCTGTTTCCTG -3']、 M13Rv(-48)は相補鎖[5'- CCTGTGTGAAATTGTTATCCGCT -3']と記載されます。
BAC
5,001bp以上の配列は、クロラムフェニコール耐性のBAC(Bacterial Artificial Chromosome) に挿入して、納品します。
BAC(Bacterial Artificial Chromosome)とは,大腸菌の人工染色体で、長い断片を保持出来る性質が有ります。
BAC2(約7kb)とBAC3(約8.3kb)のどちらかのベクターに挿入して納品します。

BACベクターの配列情報
BAC2 (約7Kb).txt
BAC3 (約8.3Kb).txt

BACベクターの扱い方
icon How To Handle Bacs PDFファイル(166KB)
Genes 納品物
  1. 合成した遺伝子 (配列長が5,000bp以下の場合は 約4µg。それ以上の長さの場合(BACベクターでの納品の場合)は、約1µgを納品予定です。)
  2. 配列確認の際の挿入断片波形データ(シーケンスデータ)(.abi)
  3. プラスミドマップ・制限酵素マップ(.pdf)
    ※2,3はIDTウェブサイトよりダウンロードしてください。

長鎖配列 (3,000bp を超えるもしくはそれに近い長さの配列)の合成確認には、Miseqを用いる場合がございます。
その場合、確認データが100Mと大きくなるため、確認の際のRAWデータはお送りしておりません。
確認結果のみのご連絡になります。ご了承下さい。
Genes 納品形態・保存方法
オリゴと同様、空気乾燥品です。
常温にてお客様にお届けします。

到着後、2週間以内に使用しない場合は-20℃にて保存をお願い致します。
なお、溶解液はTEを推奨しています。
Genes 合成困難性とは
弊社では、合成を阻害する配列や、シーケンスでの確認が難しくなる可能性がある配列を「合成困難性がある配列」と定義し、合成困難性がある場合は納期や費用を余分に頂きます。
(合成困難性があっても、その困難性が小さい場合は合成可能です。)

また、米国内での確認が必要な場合も多いため、お見積にも2-3営業日掛かる事がございます。

下記に合成困難性の一例を挙げておりますが、すべてを網羅している訳ではありません。
IDT社のサイトで合成困難性を確認できますので、お試し下さい。[確認方法 (※作成中)]

  1. ヘアピン構造を取る(相補配列がある)場合
    1. 10bp以上の相補配列で、GC含率が80%以上を超える場合
    2. 15bp以上の相補配列で、GC含率が65%を超える場合
    3. 20bp以上の相補配列がある場合
  2. GもしくはCのみが10bp以上続く場合、AもしくはTのみが24bp以上続く場合
  3. 繰り返し配列がある場合
  4. 配列全体のGC含率が65%を超えるもしくは25%を下回る場合
  5. 部分配列(150bp)のGC含率が75%以上もしくは、35%以下の場合
Genes 合成困難性の確認方法
合成困難性は、IDT社のサイトで確認することが出来ます。
上記の合成困難性に該当する場合は、弊社にコドン変換や配列修正を依頼して頂くか、
IDT社のサイトで、配列をご修正下さい。IDT社サイトの使い方(※作成中)

※弊社にご依頼頂ける場合は、icon【人工遺伝子合成 オーダーシート】 Exelファイル(499KB)の「要コドン変換」のシートにご入力のうえ、oligo@mbl.co.jpまでお送り下さい。
Genes コドン変換について
弊社では、コドン変換を無償で承っております。
生物は種ごとにそれぞれ異なる頻度でコドンを用いています。
それに伴いtRNAの存在比も異なり、存在比の少ないtRNAを指定するコドン(レアコドン、マイナーコドン)が多くなれば、タンパク質の生産量も低下すると言われています。

そのため弊社では、コドン変換として下記を行っています。
  • レアコドンを排除
  • 合成困難性を排除
  • 指定の制限酵素サイトを排除
  • 宿主とコドン頻度を近似
  • (※宿主のコドン頻度には、かずさDNA研究所様の codon usage database を用いております。)
また、任意のコドン頻度を指定して頂く事も可能です。

※弊社にご依頼頂ける場合は、icon【人工遺伝子合成 オーダーシート】 Exelファイル(499KB)の「要コドン変換」のシートにご入力のうえ、oligo@mbl.co.jpまでお送り下さい。

ご注文方法について

icon【人工遺伝子合成 オーダーシート】 Exelファイル(499KB)バイオハザードフォームに必要事項を入力し、 下記までお送り下さい。

人工遺伝子合成(Gnenes)
     
※クリックするとメーラーが起動します。
上記エクセルが開けない方はこちらをお使い下さい。
icon【人工遺伝子合成 オーダーシート】 Exel 97-2004 ファイル(1.2MB)
※一部正常に動かないセルもございますが、必要事項さえご入力いただければ特に問題ありません。
バイオハザードフォーム(Biohazard Disclosure Form)について
本製品は米国から日本への輸出品となります。米国の公的およびIDT社の自主的な輸出規制により、毒素、ウイルス由来の断片、宿主に感染性を もたらす断片、人に病気を引き起こさせる可能性のある断片など、危険な遺伝子断片であると判断された場合、受注できない場合があります。
発注いただく際、危険な遺伝子断片では無いことを証明するために、IDT社指定の「Biohazard Disclosure Form」のご提出をお願いしております。 記載方法などは、下記ワードの2枚目以降に記載しておりますので、ご参照ください。

icon【バイオハザードフォーム】 Wordファイル(40KB)

問い合わせ先について

注文方法と同様、oligo@mbl.co.jpまでご氏名と内容をお送り下さい。

下記をクリックするとメーラーが起動します。
oligo@mbl.co.jp

皆様のご注文を心よりお待ちしております。

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