総合受託トップ > NGS受託サービス mRNA-Seq

NGS受託サービス 発現解析

真核生物mRNA-seq (Type A)キャンペーン 2016年12月28日 サンプルご到着分まで

真核生物mRNA-Seq

Type A: 遺伝子発現の解析のための50 bpシングルリードのサービスです。

遺伝子発現の解析のためのmRNA-Seqのサービスを提供致します。また、オプションで発現量比較やアノテーション付加などのご要望に応じたデータ解析*も可能です。

Type B: 遺伝子発現解析に加え、スプライシングバリアントなどの構造解析が可能な100 bpペアエンドのサービスです。

Type Bでは、遺伝子発現解析に加え、スプライシングバリアントあるいは遺伝子融合などのゲノム構造の解析が可能となります。ゲノム配列情報の既知、未知を問わず、様々な生物種に対応できます。また、オプションで発現量の比較以外にも構造解析などのご要望に応じたデータ解析*も可能です。

原核生物mRNA-Seq 

細菌などの原核生物の遺伝子発現解析のための50 bpシングルリードのサービスです。

ゲノム配列情報の既知、未知を問わず、様々な原核生物に対応します。
また、オプションで発現量比較やアノテーション付加などのご要望に応じたデータ解析*も可能です。

*:データ解析は、ご研究目的に応じてご相談となります。



真核生物対応 mRNA-Seq (遺伝子発現解析からRNA構造解析まで)


サービスの内容


  発現解析 
真核生物mRNA-Seq(Type A)
発現解析 
真核生物mRNA-Seq(Type B)
使用機器 illumina® HiSeq
ライブラリー作製法 Agilent SureSelect Strand Specific RNA ライブラリ 調製キット等
解析仕様 50 bp Single-Read 100 bp Paired-End
取得データ目安 1,500万リード、750 MB 3,000万リード、3 GB
納期 4週間 8週間
解析費用 ¥103,000 /サンプル*から(税別) ¥156,000 /サンプル*から(税別)

*:8サンプル以上でご依頼の場合の解析費用です(2015年4月時点)。



サンプル サンプル量* 濃度 純度(推奨)
OD260/OD280 OD260/OD230
total RNA  2 µg以上 40 ng/µL以上 1.8~2.0 1.7以上

*:サンプル量が上記サンプル量を下回る場合は追加料金をいただくことで解析可能となる場合もございますので、別途ご相談ください。


納品物

Fastqファイル(作業報告書とFastqファイルの入ったDVDあるいはHDD)

■ オプション
 ◎信頼性の低いリードの除去 ・マッピング ・FPKM ・アノテーション付加 など(Type A、B) 
 ◎スプライスジャンクション解析 など(Type B)

Type A: RNA Access対応

FFPEサンプル由来のRNAのような分解が進んだRNA場合でもillumina TruSeq RNA Access Library Prep Kitを用いた発現解析(mRNA-seq TypeA)をご利用いただければ、解析可能な場合がございます。




原核生物 mRNA-Seq

サービスの内容


使用機器 illumina® HiSeq
ライブラリー作製法 illumina TruSeq Stranded mRNA Sample Prep Kit等
解析仕様 50 bp Single-Read
取得データ目安 1,500万リード、750 MB
納期 4週間
解析費用 ¥148,000 /サンプル*から(税別)
*:8サンプル以上でご依頼の場合の解析費用です(2015年4月時点)。

サンプル サンプル量* 濃度 純度(推奨)
OD260/OD280 OD260/OD230
total RNA  2 µg以上 40 ng/µL以上 1.8~2.0 1.7以上
*:サンプル量が上記サンプル量を下回る場合は追加料金をいただくことで解析可能となる場合もございますので、
         別途ご相談ください。

納品物

Fastqファイル(作業報告書とFastqファイルの入ったDVDあるいはHDD)

■ オプション
 ・信頼性の低いリードの除去 ・マッピング ・FPKM ・アノテーション付加 など




サービスの流れ


1 お問い合わせ
受託内容、価格など、まずはお気軽に相談ください。
2 打ち合わせ
研究目的やサンプルに関する情報を基に打ち合わせを行います。
依頼に必要な情報(分析目的、サンプル情報等)をご用意ください。
3 ご依頼
ご希望のサービスについてご依頼を承ります。
依頼書をMBL 担当者宛にメール添付にてお送りください。
4 サンプル送付
サンプルは営業日(土日祝日を除く平日)着になるようにお送りください。
5 報告書の送付
詳細はご依頼サービスによって異なります。
6 受託サービスの終了、今後の相談
サービスに関する疑問、ご質問がございましたらお気軽にお問い合わせください。


注意事項

サンプル発送の準備
・ 輸送中の不慮の破損等を防ぐため、サンプルの入ったチューブをさらにプラスチック容器(コニカルチューブ等)に入れてお送りください。
・ またお送りいただく際には、記入済みの解析依頼書も同封してください。
・ サンプルはドライアイスを充分量同梱し、冷凍便にて必ず凍結状態で送付してください。

発送時の注意点
・ サンプルご発送時にメールにてお知らせください。 
・ サンプルは乾燥、漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
・ 土日祝日を挟んだご送付はご遠慮ください。また、土日祝日着のご発送もご遠慮ください。
・ 送料手数料はお客様ご負担でお願いいたします。
・ 送付頂いたサンプルの品質検査において、量・純度が十分でない場合はサンプルの再送付をお願いいたします。3 回目以降の品質検査は、8 サンプル毎に15,000 円の費用が発生します。
・ サンプル受理後のキャンセルは、本解析の仕様上お受け致しかねますので、予めご了承ください。

その他注意事項
・ 本受託解析サービスは試験研究を目的にご利用ください。その他の目的には使用しないでください。
・ 感染性のサンプルの受け入れは行っておりません。
・ ご依頼いただくサンプルは文部科学省が定める「遺伝子組換え生物等の使用等の規制による生物の多様性の確保に関する法律」(カルタヘナ法)におけるP1レベルのサンプルに限らせていただきます。
・ ヒト由来試料(汎用培養細胞等は除きます)は必ず倫理委員会の承認(インフォームドコンセント)を得てください。
・ 提供頂くサンプルから生じる問題(安全性、インフォームドコンセント等)については、弊社ならびに解析担当所では一切責任を負いかねます。
・ サンプル情報及び得られた実験結果は、機密情報として取り扱います。
・ ヒト由来試料(汎用培養細胞等は除きます)のサンプルは必ず匿名化してください。
・ 提供頂いたサンプルは使い切るため、返却は行いません。データの保存期間は1か月間です。
・ 送付サンプルに起因するシグナル検出不能の場合ならびに解析結果がお客様の予想される結果と異なる場合、弊社ならびに解析担当所では一切責任を負いかねます。

 

関連サービス
  1. RNA binding proteinの研究に 「RiboCluster Profiler™」
  2. RNAの安定性や半減期の解析に 「BRIC-Kit」