総合受託トップ > 全ゲノム発現解析(アジレント社製マイクロアレイ)

全ゲノム発現解析(アジレント社製マイクロアレイ)

サービスの概要

total RNAサンプルをお送りいただくだけで、アジレント・テクノロジー社のDNAマイクロアレイを用いた網羅的な遺伝子発現解析を行います。
遺伝子工学に熟練した技術者が対応することにより、研究者の皆様のご研究をサポート致します。
ご要望に応じてRNA抽出からデータ解析までのご依頼が可能です。


サービスの特長

広いダイナミックレンジと高い再現性により、低発現遺伝子の網羅的な解析も可能になりました。
これまで高いレベルの研究成果を報告している研究グループの経験とノウハウを活用して、確かな結果をお届けします。
オンコミクス社の下記論文の著者が作業致します。

<参考文献>
Takeuchi T, et al., j. Clin. Oncol. 24: 1679-1688 (2006)
149症例の肺癌切除例を約18,000遺伝子のマイクロアレイで解析し、臨床的にも分子生物学的にも重要な肺癌の個性の描出を示した論文です。

サービス内容


受託項目 (使用チップ) 特長 解析数/
1アレイ※1
価格
(税別) ※2
測定法※3
SurePrint G3 Human Gene
Expression 8×60K v3
Entrez Gene = 26,083
lincRNA = 30,606
8 ¥720,000 1色法
SurePrint G3 Human Gene
Expression 8×60K v2
Entrez Gene = 24,128
lincRNA = 7,660
SurePrint G3 Human Gene
Expression 8×60K
Entrez Gene = 27,958
lincRNA = 7,419
SurePrint G3 Mouse Gene
Expression 8×60K v2
Entrez Gene = 27,122
lincRNA =4,578
8 ¥720,000 1色法
SurePrint G3 Mouse Gene
Expression 8×60K
Entrez Gene = 39,430
lincRNA =16,251
SurePrint G3 Rat Gene
Expression 8×60K v2
Entrez Gene = 30,584 8 ¥720,000 1色法
SurePrint G3 Rat Gene
Expression 8×60K
Entrez Gene = 30,003

※1:解析数が1アレイの解析数に満たない場合は、チップシェアリングをご利用ください。詳細はこちら→
※2:上記価格は変動遺伝子抽出作業込みの価格となります。
※3:2色法の測定は別途ご相談ください。

遺伝子発現解析用 受託製造アレイ

哺乳類(ヒト、マウス、ラット)
SurePrint G3 Human Gene Expression 8×60 K v1*1
Whole Human Genome 4×44 K Ver2.0
Whole Mouse Genome 4×44 K Ver2.0
Whole Rat Genome 4×44 K Ver3.0

哺乳類(その他)
Canine V2 イヌ (Canis familiaris)
Bovine V2 ウシ(Bovine)
Rhesus Monkey V2 アカゲザル(Macaca mulatta)
Porcine V2 ブタ(Sus scrofa)

植物
Rice RAP-DB イネ(NIAS-RAP-DB)
Arabidopsis V4 シロイヌナズナ(Arabidopsis thaliana)

その他 生物種
Magnaporthe V2 イネ/いもち病菌
Drosophila V2 キイロショウジョウバエ(Drosophila melanogaster)
Zebrafish V3 ゼブラフィッシュ(Danio rerio)
Xenopus V2 アフリカツメガエル(Xenopus laevis)
C.elegans V2 線虫(Caenorhabditis elegans)
Yeast V2*2 酵母(Saccharomyces Cerevisiae)

・アレイのバージョンは変更となる場合がございます。
・アジレントの4x44Kスライドフォーマットになります。
  (*1は8x60Kスライドフォーマット、*2は8x15Kスライドフォーマットです。)
・価格はお問い合わせください。
・本サービスは、チップシェアリングサービスには対応しておりません。

オプションサービス

◎微量サンプルの増幅
 ・NuGEN社Ovation® PicoSL WTA System V2を用いてcDNA増幅を行います。
 ・サンプル量・価格等についてはお問い合わせください。

◎ 組織・細胞からのRNA抽出: ¥10,000/1サンプル
               (一部の生物種においてはRNA抽出に対応致しておりません。)

◎データ解析
 Vennzu、選択遺伝子でのリスト化、GO term 解析、有意差検定等についてはお問い合わせください。

作業フロー

作業フロー
チップ名(生物種)、解析法(1色法)、サンプル数、オプション作業の有無、をご連絡ください。

測定の大まかな流れ

◎ アジレント社製チップ使用の場合

1. total RNAサンプル 受領
2. 品質確認 (アジレント社 バイオアナライザを使用)
3. cRNA合成およびCy dyeによるラベリング
4. 断片化(300~600 bp程度)処理
5. DNAマイクロアレイとのハイブリダイゼーション
6. 洗浄
7. スキャナーによる生データ読みとり
8. 変動遺伝子抽出
9. データ納品


納品物

・結果報告書
・解析データ(数値化データ、処理済みデータ)
・RNA確認結果・Probe確認結果
・変動遺伝子リスト(測定したサンプル数と同じ数の変動遺伝子解析数がご依頼いただけます。)

◎ オプションデータ解析 (GO-term、有意差検定)
・解析データ

ご注文について

依頼方法

「お問い合わせフォーム」より、お問い合わせください。

ご注文の流れ

作業フロー

お問い合わせ内容に加え、ご検討のチップ名(生物種)、サンプル数、解析法(1色法OR2色法)、解析数、オプションの有無をご連絡下さい。

サンプルの送付について

◎ サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、凍結状態を維持するために充分量の
ドライアイスを同梱し、冷凍便、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付く
ださい。
◎ 記入済み専用依頼書も印刷してサンプルに同梱してください。
◎ 以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

<サンプル送付先>
送付先は、オンコミクス社となります。

〒464-0858 名古屋市千種区千種2-22-8 名古屋医工連携インキュベータ413
株式会社 オンコミクス 担当者宛

サンプルの調整について

以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

サンプル サンプル量 濃度 純度
OD260/OD280※1 OD260/OD230
total RNA 1 µg以上 200 ng/µL以上 1.8~2.1 2.0以上
細胞・組織(オプション) 培養細胞:1x107個以上
組織:100 mg以上※2(一般的な組織の場合)ご用意ください。

*1: 分解が進んだRNAでは、正確なデータが得られない可能性があるため、電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
*2:RNA抽出作業はオンコミクス社にて対応します。一般的な組織の場合100 mg以上としております。詳細は一度お問い合せください。

◎ RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。TEバッファなどのEDTAを含むバッファに溶解した場合、データが取得できない可能性があります。もし異なる場合は、依頼書の備考欄に記載してください。
◎ RNA抽出につきまして、以下のキットの使用を推奨致します。
QIAGEN, RNeasy Mini Kit (74104)
◎ 品質が上記に満たない場合でも解析が可能な場合があります。予めご相談ください。


注意事項

*本受託解析サービスは試験研究を目的にご利用ください。また、その他の目的(医療診断等)には使用しないでください。
*ご提供いただくサンプルから生じる問題(安全性、インフォームドコンセント等)については、幣社ならびに受託解析会社では一切の責任を負いかねます。
*サンプル情報および、得られた実験結果は、機密情報として取り扱います。
*ご送付頂いたサンプルの残りは返却致しません。ご送付頂いたサンプルは、受け取り日より起算し3ヶ月間保存後に廃棄します。サンプルの返却をご希望の方は、予めご連絡ください。
*サンプルに起因するシグナル検出不能の場合、あるいは解析結果がお客様の予想される結果と異なる場合、幣社ならびに受託解析会社では一切の責任を負いかねます。
*サンプルの取り扱いには細心の注意を払いますが、万一サンプルが破損した場合、再提出をお願いする可能性があります。また、破損したサンプルについては、幣社ならびに受託解析会社ではその責任を負いかねます。
*サンプル受理後のキャンセルは、本検査の仕様上お受け致しかねますので、予めご了承ください。
*チップの納入状況によって、標準の納期より遅れる場合があります。サービスの仕様や内容は、予告なしに変更することがあります。
*アジレントはアジレント・テクノロジー社の商標または登録商標です。