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miRNA発現解析(アジレント社製マイクロアレイ)

サービスの概要

miRNAを含むtotal RNAサンプルもしくは細胞、組織をお送りいただくだけで、網羅的なmiRNA発現解析を行います。
遺伝子工学に熟練した技術者が対応することにより、研究者の皆様のご研究をサポート致します。
ご要望に応じてRNA抽出からデータ解析までのご依頼が可能です。


サービスの特長

Sanger miRBaseをもとに設計された、独自のヘアピンキャップ構造プローブにより、生理活性を持つmature miRNAを検出します。

A: hybridization sequenceの5'末端にあるG残基(黒)は、miRNAの3'末端にラベリングにより導入されたC残基(黄)と相補的に結合します。このG-C対がプローブとターゲットの反応領域に加わることで、ターゲットとなるmiRNAが、他の相同なRNAよりもプローブに安定して結合します。また、すべてのプローブには、プローブとターゲットの反応領域に隣接して5'末端ヘアピン(青)が付加されており、miRNAのサイズに対する特異性を高めています。
B:安定性が高すぎるため最適化が必要なプローブでは、miRNAの5'末端から塩基配列を除去することで、プローブとターゲットの安定性を調節しています。

図中の黒い部分は、合成された配列である未修飾のマイクロアレイプローブ(黒)で、この部分が、ターゲットとなるmiRNA(赤)とハイブリダイゼーションにより結合します。プローブはスティルト(オリゴヌクレオチドで構成された足)(茶)によりガラススライド表面に固定されています。

サービスの内容

解析対象 マイクロアレイ 特徴 解析数
/1アレイ
価格(税別)
Human miRNA Microarray,
Release 21.0, 8x60K
miRBase Release 21.0に基づきプローブ設定。
2588個のmiRNAを測定します。
8 ¥832,000
Mouse miRNA Microarray,
Release 21.0, 8x60K
miRBase Release 21.0に基づきプローブ設定。
1915個のmiRNAを測定します。
8 ¥832,000
Rat miRNA Microarray,
Release 21.0, 8x15K
miRBase Release 21.0に基づきプローブ設定。
765個のmiRNAを測定します。
8 ¥832,000

※変動miRNA抽出作業を含みません。ご要望の場合は別途ご相談ください。
※他のチップのバージョンをご利用の際はお問い合わせください。
※解析法:1色法のみとなります。

オプションサービス

◎ 組織・細胞からのRNA抽出:¥10,000/1サンプル

作業フロー

作業フロー

測定の大まかな流れ

1. miRNAを含むtotal RNA試料 受領
2. 品質確認 (アジレント社 バイオアナライザを使用)
3. 脱リン酸化反応
4. Cy dyeによるラベリング
5. マイクロRNA用chipとのハイブリダイゼーション反応
6. 洗浄
7. スキャナーによる生データ読みとり
8. データ納品

納品物

・結果報告書
・解析データ(数値化データ)
・RNA確認結果

◎ オプションデータ解析(変動miRNAリスト)
・解析データ

ご注文について

依頼方法

「お問い合わせフォーム」より、お問い合わせください。

ご注文の流れ

作業フロー

◎ お問い合わせ内容に加え、チップ名(生物種)、解析法(1色法)、サンプル数、オプションサービスの有無ににつきましてご連絡下さい。

サンプルの送付について

◎ サンプルは乾燥・漏れならびに容器破損が無いようにご注意いただき、凍結状態を維持するために充分量のドライアイスを同梱し、冷凍便、平日午前着指定でご送付ください。また遠隔地を除き、翌日必着でご送付ください。
◎ 記入済み専用依頼書も印刷してサンプルに同梱してください。
◎ 以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

<サンプル送付先>
 〒464-0858 名古屋市千種区千種2-22-8 名古屋医工連携インキュベータ413
 株式会社 オンコミクス 担当者宛

サンプルの調整について

以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

サンプル サンプル量 濃度 純度
OD260/OD280 OD260/OD230
total RNA (miRNA含む) 1 µg以上 200 ng/µL以上 1.8~2.1 2.0以上
細胞・組織 (オプション) 培養細胞:1×107個以上
組織:100 mg以上 ※1 (一般的な組織の場合)ご用意ください。

※1:RNA抽出作業はオンコミクス社にて対応します。一般的な組織の場合100mg以上としております。詳細は一度お問い合せください。

◎ RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。TEバッファなどのEDTAを含むバッファに溶解した場合、データが取得できない可能性があります。もし異なる場合は、依頼書の備考欄に記載してください。
◎ 品質が上記に満たない場合でも解析が可能な場合があります。予めご相談ください。
◎ RNA抽出につきまして、以下のいずれかのキットの使用を推奨致します。
(1) QIAGEN, miRNeasy Mini Kit. (217004)  
(2) Ambion by Life Technologies, mirVana&trade miRNA Isolation Kit, with phenol.(AM1560)
詳細は、サンプル調製前にお問い合わせください。

注意事項

・本受託解析サービスは試験研究を目的にご利用ください。また、その他の目的(医療診断等)には使用しないでください。
・ご提供いただくサンプルから生じる問題(安全性、インフォームドコンセント等)については、幣社ならびに受託解析会社では一切の責任を負いかねます。
・サンプル情報および、得られた実験結果は、機密情報として取り扱います。
・ご送付頂いたサンプルの残りは返却致しません。ご送付頂いたサンプルは、受け取り日より起算し3ヶ月間保存後に廃棄します。サンプルの返却をご希望の方は、予めご連絡ください。
・サンプルに起因するシグナル検出不能の場合、あるいは解析結果がお客様の予想される結果と異なる場合、幣社ならびに受託解析会社では一切の責任を負いかねます。
・サンプルの取り扱いには細心の注意を払いますが、万一サンプルが破損した場合、再提出をお願いする可能性があります。また、破損したサンプルについては、幣社ならびに受託解析会社ではその責任を負いかねます。
・サンプル受理後のキャンセルは、本検査の仕様上お受け致しかねますので、予めご了承ください。
・チップの納入状況によって、標準の納期より遅れる場合があります。
・サービスの仕様や内容は、予告なしに変更することがあります。
・AgilentはAgilent Technologies Inc.の商標または登録商標です。